真田家在長野縣上田市的象徴是在上田城上建築事蹟、眞田家的武學在上田城具有相當成就。仙石家在之後發展了上田政權、在關原戰役之後復興了被遺棄的上田城。在此之後、繼位成了城主松平家、從江戸時代中期開始到明治時代瓦解為止歷經７代160 年的時間就任上田藩主。松平家從17 世紀開始到19 中世紀為止與統治日本的徳川将軍家祖先是同一祖先、被世人叫做藤井松平家。松平家的初代藩主忠晴公、退隱後被稱做忠山號、與其墓地在京都並且設置了 忠山社。這也是忠山社的起源。

在明治維新改革中、由於廢藩制縣政策的實施廢除了上田藩。舊上田藩士與舊領土內的有志人士、為了要給舊藩主松平氏報恩、大家紛紛起意要在上田市設置可以祭祀, ( 初代忠山公、二代忠昭公)、三代忠周公的靈位神社。在上田城本丸跡的土地所有者『丸山平八郎氏』的堅決下、在1879年捐贈了神社用地並且創立了松平神社。

第二次世界大戦後、大家希望以真田氏以及仙谷氏以及歴代的城主進行合靈、以守護上田城跡的守護神社進而呼聲高漲。在1953 年歴代的城主藉由合靈儀式改成了上田神社、直到1963 年被改名為眞田神社、至今。